轰轰烈烈的南京保卫战，就这样在仓促撤退的混乱中悲惨地结束了。原来估计可以坚守一两个月的南京，实际上城廓保卫战只打了3天。由于撤退时的仓促和混乱，许多部队没有接到撤退命令，或者接到命令没有按命令正面突围，一齐涌向江边，而又无法渡江北撤，在混乱不堪的局面下，约有数万名军人散落在南京。后来，这些军人大部分都成为日军大屠杀的牺牲品，这些，都是唐生智将军始料未及的。

一时舆论大哗，对唐生智将军的指责纷至沓来。

1938年1月，蒋介石在武昌珞珈山召开军事会议，检讨南京战役。参加会议的有军事委员会及战区有关负责人，守卫南京的军、师长以上将领。本来，南京守卫战的失利，蒋介石优柔寡断、举棋不定也是有一定责任的，如果他当初果断采纳刘斐的意见，断不会有这样惨痛的结果。但中国的事情，历来对最高统治者的过错总是讳莫如深的，这一封建专制的残余绵延至今，谁又敢当面去刺蒋委员长的疮疤呢？蒋介石面带愠色讲话以后，从南京城死里逃生的将军们，便一齐把怒气发泄到唐生智身上。

一位将领说：“唐司令长官领导不力，指挥不当，以至10万大军防守的南京城，只守了三天便被日军攻破了。”

另一位将领更直指唐生智说：“唐将军没有下达撤退命令，自己就弃城逃走，酿成惨重的牺牲，应对后果负完全责任！”

会议气氛一时变得紧张，唐生智此时有口难辩，他身体本来就不好，南京失守后心情一直郁郁不乐，脸孔更加苍白、瘦削，额上直冒虚汗，不时用手帕擦拭着。他也感到南京失守责任重大，便没有为自己争辩，只是嗫嚅着：“一切责任都是我的，请委员长处分！”

蒋介石听了众将领发言，当时很为恼火，甚至说要组织军事法庭进行审判。

参加会议的粤军将领，八十三军军长邓龙光实在过意不去，待蒋介石怒过之后，便发言说：“南京卫戍司令长官部当时召开了军、师长会议，下达了撤退命令，我部便是根据命令由正面突围撤离南京的！”说完，邓龙光从怀中取出唐生智在撤离南京前给他下达的撤退突围命令，双手呈了上去，这才给唐生智解了围。

蒋介石看过撤退命令，怒气稍稍平息，会议的气氛才渐渐缓和过来。此后，日军在南京进行血腥大屠杀的消息不断传来，各地报纸也连续不断地进行披露。日军的暴行引起中外人士极大的愤慨，成为国际、国内舆论的焦点，唐生智将军守卫南京的功过是非，也就渐渐地不再被人们关注、议论了。