12月12日下午，大批军民向北边涌去，拉贝知道，南京的陷落已迫在眉睫了。他命令国际委员会的工人们，迅速将白底黑圈红十字的安全区旗帜，遍插在安全区四周，作为鲜明的标志，又命人将一面德国纳粹党的“卐”字旗，插到国际委员会的屋顶上。德意志是与日本结盟的国家，拉贝便利用这一关系，将象征德国法西斯统治的旗帜，巧妙地用来保护南京的难民。

12月13日凌晨5时左右，拉贝便被猛烈的空袭声吵醒了，自从昨晚得知中国守军全面撤退、突围的消息以后，他知道今天日军进入南京已经是不可避免的事情了。他早早地起床以后，便特地穿了一套笔挺的咖啡色西装，系上一条漂亮的黑色领带，稀疏的秃顶上戴着褐色的呢子礼帽。为了安全区25万难民的安全，他今天要以这身庄重的打扮，去迎接入城的日军。

在血雨腥风的活地狱南京，有一处相对安全的处所，这确是高扬着人道主义旗帜的国际安全区。

临近中午的时候，大胖子拉贝带着国际委员会的委员，右手举着安全区的旗帜，身体微微摇摆地走动着。来到了汉中路，遇见一支日军的先头部队。拉贝马上迎了上去，而且很有礼貌地招呼：“Hello！”

一个日本军官走了出来，通过身边的翻译开始和拉贝对话：“你们是什么人？到这儿有何贵干？”

拉贝回答说：“我们是南京安全区国际委员会的，特来迎接贵军，并请贵军对安全区加以切实的保护。”

“安全区在什么地方？”日本军官迟疑地询问，而且掏出随身携带的军用地图。

拉贝点点头继续说：“我们曾通过上海饶神父与贵军司令部联系，贵军司令部长官答复知道这件事，并表示假如安全区内没有军事设施和武装人员，日军不会故意施加攻击……”

日本军官在地图上寻视着，国际委员会副总干事费区马上走上前去，用手指点着安全区的范围，随后又用笔郑重地圈了下来。

日本军官点点头说：“知道了，请放心！”

拉贝紧绷的心弦放松了，西洋人愉快地向东洋人挥手告别：“Good Bye！”

回到国际委员会总办公处，有人报告说，就在拉贝一行人前往迎接日军的时候，一支日军部队进入了安全区南口，而且随意开枪射杀了20余名惊骇奔逃的难民。拉贝的愉快一扫而光了，他心情沉重地喃喃说：“如何能如此呢？！如何会如此呢？！……”

下午，拉贝马上草拟了一道公函，并请人迅速翻译成日文。

14日，拉贝、史密斯、福斯多三人，开车前往日军部队联系，要求切实解决保护安全区难民问题。他们先后拜访了五名日军长官，均不愿意接受公函。汽车在南京市内奔波着，每隔一两百米就会遇到尸体，有时尸体挡住去路，还得下车搬动。拉贝仔细审视过，都是一些平民的尸体，枪弹从后面穿透，很显然，这些百姓是在惊骇奔跑时，被日军从背后开枪射杀的。街道两边的商店里，日本士兵成群结队地洗劫财物。假如不是亲眼看见，拉贝无论怎么也不敢相信，这确是德国的盟友日本帝国的军队，堕落到已经和土匪没有区别的地步。

傍晚，他心情沉重地回到家里。

翌日，拉贝又起了一个大早，这位50余岁的老人，再次为安全区难民的命运而奔波。这天通过日本大使馆参赞福田，终于与日本特务机关负责人原田少将取得联系。中午，原田少将接见了南京安全区国际委员会主席拉贝，事后并巡视安全区一周，来到国际委员会总办公处。

拉贝与原田的谈话是由福田担任翻译的。拉贝首先表示，贵军对安全区未加轰击，不胜感激之至。随后报告安全区的情况，提出亟待解决的问题。他特别强调了两点：一、安全区各入口处，要求日军派兵把守，以保护难民的安全；二、有少数中国军人放下武器后已进入难民区，敬希贵司令动恻隐之心，使他们重过平民生活。

原田少将答复说：安全区各入口处将派兵驻守，以维持秩序；必须搜索城内的中国兵，对于已被解除武装的中国兵，可以信赖日军的仁慈态度。

拉贝的心里再一次升起希望的光芒，然而，这短暂的光芒很快便消失了。实际上日军的许诺只是对善良的再一次愚弄和欺骗。就在谈话之后，情况急转直下，血腥的屠刀和恐怖的枪声便笼罩了整个金陵。